Les méthodes de régulation de la flore intestinale dans le syndrome du côlon irritable comprennent actuellement des interventions diététiques, des médicaments antimicrobiens, des thérapies probiotiques et des transplantations fécales.

1) Interventions diététiques.La structure du régime alimentaire est un facteur déterminant de la structure et de la fonction de la flore intestinale humaine. Les régimes à long terme et à court terme affectent de manière significative ou dans une moindre mesure la composition microécologique de l'intestin. La flore intestinale peut transformer des composants alimentaires complexes en une grande variété de métabolites. Des études ont montré que les régimes à base de FODMAPs (oligosaccharides, disaccharides, monosaccharides et polyols fermentescibles) modifient les niveaux d'histamine, la composition microbienne et leurs fractions métaboliques chez les patients souffrant du syndrome du côlon irritable (IBS), avec une légère diminution de la production de H2, une diminution significative des niveaux d'histamine, une augmentation de l'abondance et de la diversité des actinomycètes, et une diminution significative de l'abondance relative et de la diversité des bactéries chez les patients suivant un régime à faible teneur en FODMAPs par rapport aux patients suivant un régime à forte teneur en FODMAPs. L'abondance relative des bactéries était significativement plus faible dans le groupe soumis à un régime riche en FODMAP.

2. les antimicrobiens.L'utilisation d'antimicrobiens dans le traitement du syndrome du côlon irritable (SCI) est actuellement controversée, car une utilisation inappropriée peut entraîner des effets indésirables supplémentaires ou de nouveaux troubles de la flore. La rifaximine est actuellement le seul médicament antimicrobien oral non absorbable approuvé par la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis pour le traitement du syndrome du côlon irritable (SCI) diarrhéique, et la majorité des études confirment son effet modulateur sur la flore intestinale du SCI. La rifaximine orale peut augmenter le nombre de bactéries bénéfiques telles que Lactobacillus et Bifidobacterium dans le tractus intestinal et diminuer le nombre de bactéries pathogènes opportunistes telles que les Enterobacteriaceae.

3. les probiotiques.On sait aujourd'hui que certains probiotiques peuvent coloniser l'intestin, comme Bifidobacterium longum et Bifidobacterium polymorphum, et faire partie de la flore intestinale, tandis que d'autres souches de bactéries peuvent survivre dans l'intestin mais ne peuvent pas le coloniser pendant une longue période, ce qui peut être dû à l'effet inhibiteur compétitif de la flore intrinsèque, comme Bifidobacterium infantis, Lactobacillus casei et Bifidobacterium animalis, qui peuvent jouer un rôle en influençant la flore intrinsèque de l'intestin. Une étude a montré que des patients souffrant du syndrome du côlon irritable et ayant reçu Bifidobacterium infantis par voie orale pendant 8 semaines présentaient une augmentation significative de l'abondance de Clostridium anisopliae fécal et des eubactéries rectales par rapport au niveau précédant le traitement.

4. les transplantations fécales.La transplantation de bactéries fécales est une méthode thérapeutique visant à reconstruire le micro-écosystème intestinal, et son application aux infections récurrentes à Clostridium difficile et aux maladies inflammatoires de l'intestin a fait des progrès significatifs. La technologie d'extraction et d'isolement des bactéries fécales est devenue de plus en plus mature, et certaines études en Europe et aux États-Unis ont tenté de l'utiliser dans le traitement du syndrome du côlon irritable. Les résultats montrent qu'elle peut atteindre un taux de guérison de 36 % (20/55) et un taux de soulagement des symptômes de 70 % à 89 %, ce qui laisse entrevoir de meilleures perspectives d'application clinique.